En un hilo sobre creación de imágenes de disquetes con protección hablamos del problema que tienen las disqueteras USB (al menos las baratas): el controlador que incorporan solo sirve para formatos estándar, así que no van a funcionar con disquetes que tengan cualquier variación sobre el estándar, como ocurre con aquellos que tienen protección física. Pero si tu idea es usar disquetes normales no vas a tener problema y en principio cumplirá con su cometido, pero no te asustes si pruebas disquetes de juegos originales y ves que no funcionan, lo más posible es que usen un sistema de protección físico.