Hola gente. Gracias por la respuestas. ¡Ya pude hacer funcionar Decay!

Buscando en san Google y Youtube encontré el sistema que se utiliza para hacer funcionar la mayoría de los mods de HL.
Lo informo por si alguien mas lo necesita:
Una vez copiada la carpeta de Decay en el directorio de HL (o el de cualquier otro mod) creen un Acceso directo del .exe de Half-life en el escritorio.
Posteriormente, sobre este acceso directo, Boton derecho del mouse y eligen propiedades.
En la ventana de Propiedades, en Destino, después de la hl.exe" dejen un espacio y agregan lo siguiente "-nomaster -game decay" (sin las comillas). Tengan en cuenta que deben respetar mayúsculas y minúsculas de la carpeta del mod. (No es lo mismo "decay" que "Decay")
También conviene cambiarle en nombre al acceso directo desde esta misma ventana para evitar confusiones
Y esto es lo mismo para la mayoría de los mods. Si por ejemplo descargan el mod Azure Sheep. Copian la carpeta del mismo en la carpeta principal de HL (en algunos casos si lo descargan como .exe el ejecutable se encarga del trabajo de copiar la carpeta) y luego repiten el proceso que describí para Decay.
Claro, obviamente cambia el nombre del mod, por lo que en este caso quedaría como "-nomaster -game asheep"
Espero que les sea util!