Estas dentro del disco duro?
En el WinUAE pusiste la opcion para que arranque desde tu disco duro?
Si ya entraste a tu disco y te encontras en el Workbench, carga la imagen que te pase dentro del WinUAE y a los segundos te tiene que aparecer en el sistema operativo un icono de un disquete (o algun icono caracteristico) y desde ahi podes usar o instalar el AmigaBASIC (aunque creo, no estoy seguro, que el AmigaBASIC no tiene una opcion para poder instalarlo en el sistema operativo, no de manera oficial)