No, la Voodoo 2 y la S3 son totalmente independientes, de tal forma que la Voodoo 2 sólo funciona en videojuegos. Puedes intentar bajarte los últimos drivers de ambas tarjetas, si tienes DirectX6.2 o superior no te molestes, que ya los llevan.
De todas formas una S3 aguanta 1024x768x16M, de sobra para lo que puedas querer...