Veamos, "version incorrecta de dos"...
Intenta cargar el controlador
SETVER.EXE en el Config.sys... el problema es que Win9X teóricamente, si no se ha trasteado en la configuración, ya lo tiene añadido... peeero (si lees el documento anterior) entonces lo que sucede es que el programa no esta añadido a la tabla interna que saber que versión debe indicar al programa. Y eso se hace así:
C:\>setver programa.exe 6.20
Pero aún así puede que no se acaben los problemas... El MS-DOS (7.0) de Win9X es una versión capada al que le faltan algunos ejecutables (por ejemplo backup.exe, xcopy, etc. si no recuerdo mal) y si el programa los usa no funcionará. Por suerte, si tienes el CD original o una copia completa, hay una copia de dichos programas en el CD de Win9X (no recuerdo la carpeta) y tan solo hay que moverlos a C:\Windows\Command
PD:Ojo que esa ayuda es para MS-DOS, para Windows se debe usar el SETVER.EXE que estará en "C:\Windows\Command" no el de "C:\DOS", y otro tema aparte sería el Config.sys a usar ya que sino recuerdo mal hay un par de ellos (además de el de "C:\" que será el que usa MD-DOS 6.2, hay otro en el directorio "C:\Windows" llamado de otra forma similar que era para cuando se ejecuta el DOS en una ventana, creo)