Buf, depende del resultado final que busques, quizá sí te va a salir mejor arremangarte.
En principio no necesitarías que lanzara aplicaciones externas, porque podrías hacer que generara un .bat con una llamada a tu ejecutable con los parámetros (-iWad, -file), o que te imprima en un fichero de texto esos parámetros para usarlos en algo como Playnite.
Por cierto que
Doom Launcher podría servirte, aunque no he llegado a probarlo porque yo fui por la calle de enmedio y me hice un programa (Java con Swing, porque es lo que medio recuerdo de la uni) precisamente para generar esos parámetros (Porque además también especifico fichero de saves, de screenshots y hasta un config.ini limpio para evitar problemas entre mods y juegos).
